انتشار بزرگترين پايگاه داده ژنوم سرطان انساني به دانشمندان در سرعت بخشيدن به تحقيقاتشان كمك شايان توجهي مي‌كند.

به گزارش پایگاه فراخوانهای علمی پژوهشی کشور (callforpapers.ir) انتشار بزرگترين پايگاه داده ژنوم كامل سرطان انساني سرعت كشف‌هاي تحقيقاتي را بالا مي‌برد. اين پايگاه داده ژنوم كلي بيماران «بيمارستان تحقيقاتي كودكان سنت جود» از حجم تركيب ساير منابع تجاوز مي‌كند.

به منظور سرعت بخشيدن به درمان سرطان و ساير بيماري‌ها بيمارستان تحقيقاتي كودكان سنت جود كه «پروژه ژنوم سرطان كودكان» دانشگاه واشنگتن است، بزرگترين انتشار پايگاه داده ژنوم كامل سرطان انساني را گزارش كرد. اين امر با هدف دسترسي سريع جامعه علمي جهاني به اين داده‌ها صورت مي‌گيرد.

كميت اطلاعات منتشر شده بيش از دو برابر حجم تمامي داده‌هاي ژنومي كه در حال حاضر از منابع تركيب شده ژنوم سرطان انساني موجود است، گزارش شده است. اين اطلاعات نه تنها براي محققان سرطان بلكه براي تمام دانشمندان مطالعه‌كننده تمامي بيماري‌ها كارآمد است.

حدود 520 توالي‌ ژنوم منتشر شده مجموعه پيوندي از نمونه‌هاي بافت‌هاي سرطاني و نرمال گرفته شده از 260 بيمار كودك سرطاني عنوان شده‌اند.

انتظار مي‌رود «پروژه ژنوم سرطاني كودكان» بيش از يك هزار و 200 ژنوم را تا پايان سال جاري ميلادي توالي بخشد. هر نمونه موردي در سطح كنترل كيفيت تحت عنوان پوشش برابر 30 (fold coverage) تولي داده مي‌شود و بيشينه دقت را تضمين مي‌كند.

محققان سنت جود هم‌اكنون در حال تحليل توالي ژنومي با هدف تعيين تفاوت‌هاي بين سلول‌هاي سرطاني و نرمال هر كودك است و اين امر به منظور كشف عامل‌هاي بيش از شش نوع مرگبارترين سرطان در كودكان صورت مي‌گيرد. اين تلاش تاكنون موفق به انجام كشف‌هاي كليدي شده كه در ژورنال‌هاي علمي انتشار يافته‌اند.

«جيمز داوينگ» دانشمند مركز سنت جود مي‌گويد: اين تلاش كشف‌هاي فراتر از تصور ما را موجب شده و در نظر داريم اين اطلاعات را در اختيار جامعه علمي گسترده‌اي قرار دهيم تا همگي به طور دسته‌جمعي گزينه‌هاي درماني را براي اين كودكان كنكاش كنيم. ما اميدواريم با سهيم كردن اين داده‌ها حتي قبل از تحليل خود ما، ديگر محققان از اين منبع غني براي دستيابي به بينش‌هايي در خصوص بسياري از انواع ديگر بيماري‌ها در كودكان و بزرگسالان بهره گيرند.

«پروژه ژنوم سرطان كودكان» در اوايل سال 2010 تاسيس شد و تاكنون بزرگترين تلاش و سرمايه‌گذاري در جهان با هدف درك منشاهاي ژنتيكي سرطان كودكان بوده است. هزينه اين پروژه سه ساله 65 ميليون دلار تخمين زده شده و سنت جود 55 ميليون دلار از اين رقم را تقبل كرده كه 20 ميليون دلار آن توسط Kay Jewellers شريك بلند مدت سنت جود تامين شده است. اين نخستين پروژه خصوصي توالي‌كننده ژنوم انسان است كه داده‌هاي خود را به محض در دسترس قرار گرفتن سهيم خواهد كرد. تا به امروز اين نوع دسترسي آزاد به تلاش‌هايي با بودجه دولتي محدود شده بود و تلاش‌هاي غيردولتي اين داده‌ها را در انحصار خود نگه داشته بودند.

دكتر «ويليام ايي ايوانز» نيز اظهار داشت: انجام اين كار سهيم كردن اطلاعاتي است كه از زمان افتتاح سنت جود در 50 سال قبل جمع‎آوري شده است.

«پروژه ژنوم سرطاني كودكان» يك تلاش بي‌نظير در نوع خود بوده و بنابراين اين اطلاعات داراي پتانسيل لازم براي سرعت بخشيدن به تحقيقات در خصوص بيماري‌هاي مختلف در سراسر جهان است.

بدين وسيله محققان در سراسر جهان قادر خواهند بود به داده توالي از طريق «آرشيو فنوم-ژنوم اروپا» مبتني بر وب كه بزرگترين مجموعه داده را براي دسترسي رايگان از طريق وب‌سايت www.ebi.ac.uk/ega/organisations/EGAO00000000046. در اختيار قرار داده، مراجعه كنند.